Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Me1P06801 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Me1P06801 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Me1P06801 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Me1P06801 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Me1P06801 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Me1P06801 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Me1P06801 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Me1P06801 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Me1P06801 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Me1P06801 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Me1P06801 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Me1P06801 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Me1P06801 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Me1P06801 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Me1P06801 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Me1P06801 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Me1P06801 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Me1P06801 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Me1P06801 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Me1P06801 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Me1P06801 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Me1P06801 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Me1P06801 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Me1P06801 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Me1P06801 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Me1P06801 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Me1P06801 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Me1P06801 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Me1P06801 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Me1P06801 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Me1P06801 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Me1P06801 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Me1P06801 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Me1P06801 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Me1P06801 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Me1P06801 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Me1P06801 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Me1P06801 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Me1P06801 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Me1P06801 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Me1P06801 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Me1P06801 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Me1P06801 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Me1P06801 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Me1P06801 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Me1P06801 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Me1P06801 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Me1P06801 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Me1P06801 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Me1P06801 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Me1P06801 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Me1P06801 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Me1P06801 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Me1P06801 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Me1P06801 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Me1P06801 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Me1P06801 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Me1P06801 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Me1P06801 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Me1P06801 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Me1P06801 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Me1P06801 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Me1P06801 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Me1P06801 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Me1P06801 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Me1P06801 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Me1P06801 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Me1P06801 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Me1P06801 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Me1P06801 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Me1P06801 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Me1P06801 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Me1P06801 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Me1P06801 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Me1P06801 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Me1P06801 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Me1P06801 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Me1P06801 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Me1P06801 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Me1P06801 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Me1P06801 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Me1P06801 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Me1P06801 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Me1P06801 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Me1P06801 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Me1P06801 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Me1P06801 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Me1P06801 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Me1P06801 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Me1P06801 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Me1P06801 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Me1P06801 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Me1P06801 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Me1P06801 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Me1P06801 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Me1P06801 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Me1P06801 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Me1P06801 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Me1P06801 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms