Protein–RNA interactions for Protein: P01216

Cga, Glycoprotein hormones alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgaP01216 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgaP01216 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgaP01216 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgaP01216 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CgaP01216 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgaP01216 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgaP01216 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CgaP01216 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgaP01216 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgaP01216 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CgaP01216 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CgaP01216 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CgaP01216 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CgaP01216 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgaP01216 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgaP01216 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CgaP01216 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CgaP01216 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgaP01216 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CgaP01216 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgaP01216 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CgaP01216 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CgaP01216 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CgaP01216 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CgaP01216 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CgaP01216 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgaP01216 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CgaP01216 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgaP01216 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgaP01216 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgaP01216 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CgaP01216 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CgaP01216 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CgaP01216 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CgaP01216 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CgaP01216 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CgaP01216 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CgaP01216 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CgaP01216 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CgaP01216 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgaP01216 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgaP01216 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgaP01216 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CgaP01216 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CgaP01216 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgaP01216 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgaP01216 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgaP01216 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CgaP01216 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CgaP01216 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CgaP01216 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CgaP01216 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgaP01216 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgaP01216 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CgaP01216 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CgaP01216 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CgaP01216 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CgaP01216 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgaP01216 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CgaP01216 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgaP01216 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgaP01216 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CgaP01216 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CgaP01216 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CgaP01216 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CgaP01216 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CgaP01216 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CgaP01216 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CgaP01216 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CgaP01216 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CgaP01216 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CgaP01216 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CgaP01216 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CgaP01216 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CgaP01216 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CgaP01216 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CgaP01216 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CgaP01216 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CgaP01216 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CgaP01216 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CgaP01216 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CgaP01216 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CgaP01216 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CgaP01216 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CgaP01216 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CgaP01216 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CgaP01216 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CgaP01216 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgaP01216 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgaP01216 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgaP01216 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgaP01216 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgaP01216 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgaP01216 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgaP01216 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgaP01216 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CgaP01216 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CgaP01216 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CgaP01216 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CgaP01216 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms