Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casp8O89110 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Casp8O89110 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casp8O89110 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casp8O89110 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Casp8O89110 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp8O89110 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casp8O89110 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp8O89110 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp8O89110 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp8O89110 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casp8O89110 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casp8O89110 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp8O89110 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp8O89110 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casp8O89110 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp8O89110 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp8O89110 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms