Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Setdb1O88974 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Setdb1O88974 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Setdb1O88974 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Setdb1O88974 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Setdb1O88974 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Setdb1O88974 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Setdb1O88974 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Setdb1O88974 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Setdb1O88974 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Setdb1O88974 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Setdb1O88974 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Setdb1O88974 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Setdb1O88974 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Setdb1O88974 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Setdb1O88974 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Setdb1O88974 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Setdb1O88974 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Setdb1O88974 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Setdb1O88974 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Setdb1O88974 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Setdb1O88974 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Setdb1O88974 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setdb1O88974 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setdb1O88974 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setdb1O88974 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Setdb1O88974 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Setdb1O88974 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Setdb1O88974 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Setdb1O88974 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Setdb1O88974 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Setdb1O88974 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Setdb1O88974 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Setdb1O88974 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Setdb1O88974 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Setdb1O88974 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Setdb1O88974 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Setdb1O88974 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Setdb1O88974 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setdb1O88974 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Setdb1O88974 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Setdb1O88974 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Setdb1O88974 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Setdb1O88974 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Setdb1O88974 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Setdb1O88974 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Setdb1O88974 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Setdb1O88974 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms