Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn1O88704 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn1O88704 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn1O88704 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hcn1O88704 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn1O88704 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn1O88704 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hcn1O88704 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hcn1O88704 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hcn1O88704 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hcn1O88704 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hcn1O88704 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hcn1O88704 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms