Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klc1O88447 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klc1O88447 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klc1O88447 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klc1O88447 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klc1O88447 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klc1O88447 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc1O88447 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc1O88447 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc1O88447 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klc1O88447 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klc1O88447 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klc1O88447 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klc1O88447 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klc1O88447 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc1O88447 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klc1O88447 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klc1O88447 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Klc1O88447 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klc1O88447 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms