Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AvilO88398 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AvilO88398 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AvilO88398 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AvilO88398 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AvilO88398 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AvilO88398 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AvilO88398 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AvilO88398 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AvilO88398 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AvilO88398 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AvilO88398 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AvilO88398 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AvilO88398 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AvilO88398 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AvilO88398 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AvilO88398 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AvilO88398 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AvilO88398 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AvilO88398 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AvilO88398 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AvilO88398 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AvilO88398 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AvilO88398 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AvilO88398 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AvilO88398 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AvilO88398 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AvilO88398 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AvilO88398 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AvilO88398 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AvilO88398 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AvilO88398 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AvilO88398 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AvilO88398 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AvilO88398 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AvilO88398 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AvilO88398 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AvilO88398 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AvilO88398 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AvilO88398 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AvilO88398 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AvilO88398 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AvilO88398 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AvilO88398 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AvilO88398 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AvilO88398 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AvilO88398 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AvilO88398 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AvilO88398 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AvilO88398 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AvilO88398 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AvilO88398 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AvilO88398 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AvilO88398 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AvilO88398 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AvilO88398 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AvilO88398 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AvilO88398 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AvilO88398 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AvilO88398 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AvilO88398 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AvilO88398 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AvilO88398 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AvilO88398 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AvilO88398 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AvilO88398 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AvilO88398 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AvilO88398 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AvilO88398 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AvilO88398 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AvilO88398 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AvilO88398 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AvilO88398 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AvilO88398 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AvilO88398 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AvilO88398 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AvilO88398 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AvilO88398 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AvilO88398 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AvilO88398 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AvilO88398 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AvilO88398 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AvilO88398 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AvilO88398 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AvilO88398 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AvilO88398 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AvilO88398 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AvilO88398 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AvilO88398 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AvilO88398 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AvilO88398 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AvilO88398 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AvilO88398 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AvilO88398 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AvilO88398 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AvilO88398 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AvilO88398 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AvilO88398 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AvilO88398 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AvilO88398 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms