Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx12O70493 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx12O70493 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx12O70493 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx12O70493 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx12O70493 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Snx12O70493 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx12O70493 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx12O70493 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snx12O70493 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx12O70493 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx12O70493 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snx12O70493 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx12O70493 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx12O70493 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx12O70493 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx12O70493 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx12O70493 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx12O70493 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx12O70493 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx12O70493 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx12O70493 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx12O70493 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snx12O70493 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snx12O70493 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx12O70493 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx12O70493 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Snx12O70493 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx12O70493 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx12O70493 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx12O70493 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx12O70493 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx12O70493 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx12O70493 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx12O70493 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx12O70493 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx12O70493 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx12O70493 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx12O70493 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx12O70493 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx12O70493 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx12O70493 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms