Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
HcrtO55241 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
HcrtO55241 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24,51■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
HcrtO55241 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,5■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24,5■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24,48■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
HcrtO55241 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
HcrtO55241 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24,39■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
HcrtO55241 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
HcrtO55241 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24,37■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
HcrtO55241 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24,36■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
HcrtO55241 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
HcrtO55241 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
HcrtO55241 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
HcrtO55241 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,32■■□□□ 1,48
HcrtO55241 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,32■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
HcrtO55241 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
HcrtO55241 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
HcrtO55241 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
HcrtO55241 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
HcrtO55241 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24,24■■□□□ 1,47
HcrtO55241 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
HcrtO55241 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
HcrtO55241 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
HcrtO55241 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
HcrtO55241 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
HcrtO55241 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
HcrtO55241 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
HcrtO55241 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24,2■■□□□ 1,47
HcrtO55241 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
HcrtO55241 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
HcrtO55241 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
HcrtO55241 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
HcrtO55241 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,09■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24,09■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
HcrtO55241 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
HcrtO55241 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
HcrtO55241 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
HcrtO55241 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
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