Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nck2O55033 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nck2O55033 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nck2O55033 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nck2O55033 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nck2O55033 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nck2O55033 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nck2O55033 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nck2O55033 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nck2O55033 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nck2O55033 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nck2O55033 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nck2O55033 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Nck2O55033 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nck2O55033 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nck2O55033 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nck2O55033 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nck2O55033 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nck2O55033 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nck2O55033 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nck2O55033 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nck2O55033 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Nck2O55033 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nck2O55033 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nck2O55033 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nck2O55033 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nck2O55033 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nck2O55033 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nck2O55033 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nck2O55033 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Nck2O55033 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms