Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc3O55013 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trappc3O55013 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trappc3O55013 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trappc3O55013 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc3O55013 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc3O55013 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc3O55013 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc3O55013 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc3O55013 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trappc3O55013 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc3O55013 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc3O55013 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc3O55013 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc3O55013 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms