Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Limk2O54785 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Limk2O54785 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Limk2O54785 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Limk2O54785 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Limk2O54785 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Limk2O54785 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Limk2O54785 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Limk2O54785 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Limk2O54785 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Limk2O54785 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Limk2O54785 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Limk2O54785 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Limk2O54785 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limk2O54785 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limk2O54785 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limk2O54785 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Limk2O54785 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Limk2O54785 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Limk2O54785 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Limk2O54785 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Limk2O54785 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Limk2O54785 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Limk2O54785 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Limk2O54785 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Limk2O54785 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms