Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccr6O54689 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccr6O54689 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccr6O54689 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccr6O54689 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr6O54689 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr6O54689 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr6O54689 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms