Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab33bO35963 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33bO35963 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33bO35963 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab33bO35963 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab33bO35963 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab33bO35963 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms