Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl25O35903 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccl25O35903 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccl25O35903 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccl25O35903 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl25O35903 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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