Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pold2O35654 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pold2O35654 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pold2O35654 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pold2O35654 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pold2O35654 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pold2O35654 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pold2O35654 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pold2O35654 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pold2O35654 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pold2O35654 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pold2O35654 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pold2O35654 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pold2O35654 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pold2O35654 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pold2O35654 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pold2O35654 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pold2O35654 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pold2O35654 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pold2O35654 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pold2O35654 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pold2O35654 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold2O35654 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pold2O35654 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pold2O35654 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pold2O35654 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pold2O35654 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pold2O35654 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pold2O35654 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pold2O35654 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pold2O35654 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms