Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Npc1O35604 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npc1O35604 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Npc1O35604 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npc1O35604 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npc1O35604 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npc1O35604 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Npc1O35604 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Npc1O35604 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Npc1O35604 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Npc1O35604 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1O35604 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Npc1O35604 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Npc1O35604 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npc1O35604 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1O35604 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npc1O35604 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms