Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccrl2O35457 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccrl2O35457 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccrl2O35457 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccrl2O35457 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccrl2O35457 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccrl2O35457 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccrl2O35457 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccrl2O35457 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccrl2O35457 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccrl2O35457 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccrl2O35457 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccrl2O35457 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms