Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn6O35454 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn6O35454 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn6O35454 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clcn6O35454 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clcn6O35454 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Clcn6O35454 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clcn6O35454 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms