Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Polr1aO35134 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Polr1aO35134 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Polr1aO35134 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Polr1aO35134 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Polr1aO35134 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Polr1aO35134 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Polr1aO35134 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Polr1aO35134 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Polr1aO35134 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Polr1aO35134 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Polr1aO35134 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Polr1aO35134 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Polr1aO35134 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Polr1aO35134 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Polr1aO35134 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Polr1aO35134 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
Polr1aO35134 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Polr1aO35134 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Polr1aO35134 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Polr1aO35134 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Polr1aO35134 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Polr1aO35134 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Polr1aO35134 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Polr1aO35134 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Polr1aO35134 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Polr1aO35134 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Polr1aO35134 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Polr1aO35134 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Polr1aO35134 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Polr1aO35134 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Polr1aO35134 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Polr1aO35134 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Polr1aO35134 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Polr1aO35134 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Polr1aO35134 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Polr1aO35134 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Polr1aO35134 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Polr1aO35134 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Polr1aO35134 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Polr1aO35134 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Polr1aO35134 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Polr1aO35134 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Polr1aO35134 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Polr1aO35134 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Polr1aO35134 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Polr1aO35134 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Polr1aO35134 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Polr1aO35134 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Polr1aO35134 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Polr1aO35134 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Polr1aO35134 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Polr1aO35134 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Polr1aO35134 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Polr1aO35134 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Polr1aO35134 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Polr1aO35134 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Polr1aO35134 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Polr1aO35134 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Polr1aO35134 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Polr1aO35134 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms