Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Grcc10O35127 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Grcc10O35127 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grcc10O35127 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grcc10O35127 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grcc10O35127 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms