Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ArxO35085 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ArxO35085 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ArxO35085 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ArxO35085 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ArxO35085 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ArxO35085 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ArxO35085 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ArxO35085 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ArxO35085 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ArxO35085 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ArxO35085 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ArxO35085 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ArxO35085 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ArxO35085 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ArxO35085 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ArxO35085 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ArxO35085 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ArxO35085 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ArxO35085 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ArxO35085 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ArxO35085 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ArxO35085 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ArxO35085 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ArxO35085 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ArxO35085 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ArxO35085 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ArxO35085 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ArxO35085 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ArxO35085 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ArxO35085 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ArxO35085 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ArxO35085 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ArxO35085 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ArxO35085 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ArxO35085 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ArxO35085 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ArxO35085 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ArxO35085 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ArxO35085 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ArxO35085 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ArxO35085 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ArxO35085 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ArxO35085 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ArxO35085 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ArxO35085 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ArxO35085 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ArxO35085 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ArxO35085 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ArxO35085 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ArxO35085 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ArxO35085 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ArxO35085 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ArxO35085 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ArxO35085 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ArxO35085 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ArxO35085 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ArxO35085 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ArxO35085 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ArxO35085 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ArxO35085 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ArxO35085 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ArxO35085 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ArxO35085 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ArxO35085 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ArxO35085 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ArxO35085 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ArxO35085 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ArxO35085 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ArxO35085 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ArxO35085 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ArxO35085 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ArxO35085 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ArxO35085 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ArxO35085 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ArxO35085 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ArxO35085 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ArxO35085 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ArxO35085 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ArxO35085 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ArxO35085 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ArxO35085 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ArxO35085 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ArxO35085 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ArxO35085 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ArxO35085 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ArxO35085 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ArxO35085 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ArxO35085 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ArxO35085 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ArxO35085 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ArxO35085 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ArxO35085 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ArxO35085 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ArxO35085 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ArxO35085 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ArxO35085 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ArxO35085 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ArxO35085 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ArxO35085 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms