Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2-Q1O19441 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q1O19441 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q1O19441 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H2-Q1O19441 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q1O19441 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q1O19441 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-Q1O19441 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-Q1O19441 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-Q1O19441 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q1O19441 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q1O19441 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-Q1O19441 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q1O19441 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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