Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3aO08759 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3aO08759 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3aO08759 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ube3aO08759 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ube3aO08759 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ube3aO08759 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ube3aO08759 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ube3aO08759 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ube3aO08759 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube3aO08759 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ube3aO08759 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms