Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gm5814J3QP80 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gm5814J3QP80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gm5814J3QP80 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gm5814J3QP80 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gm5814J3QP80 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gm5814J3QP80 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gm5814J3QP80 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Gm5814J3QP80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Gm5814J3QP80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gm5814J3QP80 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Gm5814J3QP80 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gm5814J3QP80 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gm5814J3QP80 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Gm5814J3QP80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Gm5814J3QP80 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gm5814J3QP80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gm5814J3QP80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Gm5814J3QP80 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Gm5814J3QP80 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gm5814J3QP80 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gm5814J3QP80 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,6
Gm5814J3QP80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gm5814J3QP80 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gm5814J3QP80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms