Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21060J3KMU4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm21060J3KMU4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21060J3KMU4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21060J3KMU4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21060J3KMU4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21060J3KMU4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms