Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17ldG5E8G2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17ldG5E8G2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17ldG5E8G2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17ldG5E8G2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17ldG5E8G2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp17ldG5E8G2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Usp17ldG5E8G2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp17ldG5E8G2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17ldG5E8G2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17ldG5E8G2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp17ldG5E8G2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp17ldG5E8G2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Usp17ldG5E8G2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp17ldG5E8G2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp17ldG5E8G2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp17ldG5E8G2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp17ldG5E8G2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp17ldG5E8G2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp17ldG5E8G2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Usp17ldG5E8G2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Usp17ldG5E8G2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp17ldG5E8G2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp17ldG5E8G2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp17ldG5E8G2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp17ldG5E8G2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms