Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r67G5E8C1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r67G5E8C1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Vmn1r67G5E8C1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Vmn1r67G5E8C1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vmn1r67G5E8C1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vmn1r67G5E8C1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms