Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sh3tc1G3X9F6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sh3tc1G3X9F6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sh3tc1G3X9F6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Sh3tc1G3X9F6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sh3tc1G3X9F6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sh3tc1G3X9F6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sh3tc1G3X9F6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sh3tc1G3X9F6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sh3tc1G3X9F6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sh3tc1G3X9F6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sh3tc1G3X9F6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sh3tc1G3X9F6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sh3tc1G3X9F6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sh3tc1G3X9F6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sh3tc1G3X9F6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sh3tc1G3X9F6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sh3tc1G3X9F6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sh3tc1G3X9F6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sh3tc1G3X9F6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sh3tc1G3X9F6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sh3tc1G3X9F6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sh3tc1G3X9F6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sh3tc1G3X9F6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Sh3tc1G3X9F6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sh3tc1G3X9F6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sh3tc1G3X9F6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sh3tc1G3X9F6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Sh3tc1G3X9F6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sh3tc1G3X9F6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sh3tc1G3X9F6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sh3tc1G3X9F6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sh3tc1G3X9F6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sh3tc1G3X9F6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sh3tc1G3X9F6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Sh3tc1G3X9F6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sh3tc1G3X9F6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sh3tc1G3X9F6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sh3tc1G3X9F6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sh3tc1G3X9F6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sh3tc1G3X9F6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sh3tc1G3X9F6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sh3tc1G3X9F6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms