Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm44G3UW88 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm44G3UW88 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm44G3UW88 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm44G3UW88 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm44G3UW88 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm44G3UW88 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm44G3UW88 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm44G3UW88 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm44G3UW88 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm44G3UW88 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm44G3UW88 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm44G3UW88 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm44G3UW88 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms