Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5160F8VPN3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5160F8VPN3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gm5160F8VPN3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm5160F8VPN3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm5160F8VPN3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm5160F8VPN3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5160F8VPN3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm5160F8VPN3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5160F8VPN3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5160F8VPN3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5160F8VPN3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm5160F8VPN3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm5160F8VPN3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm5160F8VPN3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm5160F8VPN3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms