Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm5218F6YH22 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm5218F6YH22 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm5218F6YH22 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm5218F6YH22 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms