Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep350E9Q309 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep350E9Q309 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep350E9Q309 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep350E9Q309 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms