Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L9

Gm11011, Predicted gene 11011, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11011D3Z3L9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm11011D3Z3L9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11011D3Z3L9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm11011D3Z3L9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm11011D3Z3L9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms