Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kif28pD3YXS5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kif28pD3YXS5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kif28pD3YXS5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif28pD3YXS5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif28pD3YXS5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kif28pD3YXS5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms