Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx8D3YU81 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx8D3YU81 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx8D3YU81 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx8D3YU81 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx8D3YU81 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx8D3YU81 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rfx8D3YU81 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx8D3YU81 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx8D3YU81 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx8D3YU81 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx8D3YU81 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx8D3YU81 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rfx8D3YU81 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rfx8D3YU81 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rfx8D3YU81 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rfx8D3YU81 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms