Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdzd8B9EJ80 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdzd8B9EJ80 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdzd8B9EJ80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd8B9EJ80 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd8B9EJ80 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd8B9EJ80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd8B9EJ80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms