Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tbc1d2B1AVH7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tbc1d2B1AVH7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tbc1d2B1AVH7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d2B1AVH7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d2B1AVH7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tbc1d2B1AVH7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tbc1d2B1AVH7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tbc1d2B1AVH7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tbc1d2B1AVH7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tbc1d2B1AVH7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tbc1d2B1AVH7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tbc1d2B1AVH7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tbc1d2B1AVH7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tbc1d2B1AVH7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d2B1AVH7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d2B1AVH7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d2B1AVH7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tbc1d2B1AVH7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tbc1d2B1AVH7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tbc1d2B1AVH7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tbc1d2B1AVH7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms