Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm16430A6X8J1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm16430A6X8J1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm16430A6X8J1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm16430A6X8J1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm16430A6X8J1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm16430A6X8J1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm16430A6X8J1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm16430A6X8J1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm16430A6X8J1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm16430A6X8J1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm16430A6X8J1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm16430A6X8J1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm16430A6X8J1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm16430A6X8J1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms