Protein–RNA interactions for Protein: A2BI93

Ssxb9, Synovial sarcoma, X member B9, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb9A2BI93 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ssxb9A2BI93 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ssxb9A2BI93 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ssxb9A2BI93 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ssxb9A2BI93 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssxb9A2BI93 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ssxb9A2BI93 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ssxb9A2BI93 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ssxb9A2BI93 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ssxb9A2BI93 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ssxb9A2BI93 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ssxb9A2BI93 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ssxb9A2BI93 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssxb9A2BI93 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ssxb9A2BI93 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssxb9A2BI93 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssxb9A2BI93 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ssxb9A2BI93 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms