Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc43a3A2AVZ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc43a3A2AVZ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc43a3A2AVZ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc43a3A2AVZ9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc43a3A2AVZ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc43a3A2AVZ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc43a3A2AVZ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms