Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trbv2A0A0B4J1G8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trbv2A0A0B4J1G8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trbv2A0A0B4J1G8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv2A0A0B4J1G8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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