Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psma4Q9R1P0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms