Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Npas3Q9QZQ0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Npas3Q9QZQ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms