Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cbx8Q9QXV1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cbx8Q9QXV1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms