Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tspan4Q9DCK3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tspan4Q9DCK3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tspan4Q9DCK3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms