Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt88Q9CPR6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms