Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim12aQ99PQ1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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