Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GpnmbQ99P91 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GpnmbQ99P91 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms