Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SptssbQ925E8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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